De Keizersgrachtkerk bevindt zich aan de Keizersgracht, nummer 566 (aan de kant van het Leidseplein), tussen de Leidsestraat en de Nieuwe Spiegelstraat.
Openbaar Vervoer:
Via de Noord-Zuidlijn (Metrolijn 52) kan het beste gebruik worden gemaakt van halte Vijzelgracht. Het is daarna circa 500m lopen via de Vijzelgracht en Vijzelstraat (richting de Munt) en waarna voor het water linksaf kan worden geslagen de Keizersgracht op.
Op de Leidsestraat (halte Keizersgracht), op ongeveer 100m lopen van de kerk, stoppen 2 trams: lijn 2 en 12. Beide rijden vanaf Amsterdam CS. Van de andere kant komt lijn 2 vanaf Nieuw Sloten en kruist metro/ringlijn 50 bij metrostation Heemstedestraat, lijn 12 komt vanaf het Amstelstation.
Ietsje verder, op het Leidseplein, stoppen de trams 1 (die heen en weer rijdt tussen Osdorp/De Aker en het Muiderpoortstation) en 5 (Amstelveen Stadshart - Zoutkeetsgracht).
N.b.: van 29 april tot 2 augustus worden de tramsporen in de Leidsestraat vernieuwd en rijden trams 2 en 12 een iets andere route. Dichtsbijzijnde halte is dan het Leidseplein.
Auto:
Voor wie met de auto wil komen: zoals in het grootste deel van Amsterdam geldt rondom de Keizersgrachtkerk betaald parkeren. En het moet gezegd: de tarieven liegen er niet om. Daarnaast is het aantal parkeervakken beperkt. Als je de mogelijkheid hebt, valt het wellicht te overwegen om op andere wijze naar het centrum van Amsterdam te komen, bijvoorbeeld door te parkeren op een P&R-lokatie aan de rand van de stad en van daar met openbaar vervoer verder te reizen.